Nacido en Bilbao en 1961, Juan Mari Aburto es Licenciado en Derecho por la Universidad de Deusto (1979-1984), Diplomado en la Especialidad Jurídico Económica por la Universidad de Deusto (1979-1984), y cuenta con un Diploma en Evaluación de Políticas Públicas.
Ha ostentato cargos de gran relevancia tanto en el Gobierno Vasco, dónde ejerció de Consejero de Empleo y Asuntos Sociales (2012-2015) y de Director de Servicios del Departamento de Interior (1991-1994), como en la Diputación Foral de Bizkaia, donde asumió las responsabilidades del cargo de Diputado foral de Presidencia, Teniente de Diputado General y Portavoz (2011 – 2012); Diputado foral de Acción Social (2003-2007 y 2007-2011). Portavoz desde el 2010; Director General de Régimen Jurídico y Función Pública (1994-2003). Además, fue apoderado en juntas generales de Bizkaia por EAJ-PNV (julio 2011- diciembre 2012). Desde 2015, preside la alcaldía de la ciudad de Bilbao.